Thông số kỹ thuật của máy hủy chất thải y tế chủ yếu phụ thuộc vào công suất xử lý và các tình huống áp dụng. Máy hủy tài liệu loại nhỏ thường được thiết kế với công suất xử lý hàng ngày khoảng 50–200 kg, phù hợp với bệnh viện cộng đồng, phòng khám và phòng thí nghiệm; thiết bị cỡ vừa và lớn có thể xử lý từ 500 kg đến vài tấn, phù hợp với các cơ sở y tế lớn hoặc trung tâm xử lý chất thải y tế tập trung. Khả năng xử lý khác nhau sẽ dẫn đến sự thay đổi tương ứng về kích thước, trọng lượng và công suất của thiết bị.
Về thông số kỹ thuật kết cấu, buồng nghiền và thiết kế lưỡi cắt của máy hủy tài liệu cũng là những chỉ số chính. Số lượng lưỡi dao, loại lưỡi cắt, tốc độ quay và kích thước hạt đầu ra đều ảnh hưởng trực tiếp đến hiệu quả băm nhỏ. Thiết bị có thông số kỹ thuật cao thường sử dụng thiết kế nhiều lưỡi, quay tốc độ cao, có khả năng xử lý nhiều chất thải y tế khác nhau như ống tiêm, ống truyền và chai thuốc, đồng thời đảm bảo cắt nhỏ đồng đều cho lần khử trùng tiếp theo. Các thông số kỹ thuật của hệ thống điện và phụ trợ cũng là những thông số quan trọng. Công suất thiết bị, điện áp, loại hệ thống truyền tải và mức độ tự động hóa của hệ thống điều khiển cần được xác định dựa trên môi trường vận hành và yêu cầu về tải. Thiết bị có thông số kỹ thuật cao thường được trang bị các thiết bị bảo vệ an toàn, bảo vệ quá tải và chức năng tự động tắt để đảm bảo an toàn cho người vận hành đồng thời cải thiện độ ổn định và độ tin cậy của thiết bị.